Formation

En amont de l’ouverture du congrès, une formation aura lieu le lundi 30 juin au matin.

Celle-ci aura pour sujet les réseaux moléculaires :

Classification et annotation de spectres MS/MS par réseau moléculaire

Qui n’a pas été confronté un jour à l’interprétation d’un spectre MS/MS d’une espèce inconnue ? Comment accélérer ce processus face à des milliers de spectres MS/MS issus d’acquisition automatisée ?

C’est à travers ces deux questions que la formation visera à donner les bases de l’interprétation des données MS/MS via des outils de chimioinformatique, en particulier les réseaux moléculaires.

Une première partie sera consacrée à l’obtention de données MS/MS de qualité, puis leur regroupement par famille chimique sur la base de leur similarité spectrale. Les outils de génération de spectres de fragmentation théoriques seront aussi abordés afin de permettre une annotation plus rapide et robuste des jeux de données MS/MS. Finalement des exemples basés sur l’obtention de données LC-MS/MS, mais aussi GC-MS et MALDI-MS/MS, seront présentés pour illustrer les workflows mis en œuvre.

Cette formation sera animée par :

• Dr David TOUBOUL - DR CNRS / Institut Polytechnique de Paris
• Dr Marceau LEVASSEUR - INRAE / ICSN